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[/color:27sk35bb][color=#FF8000:27sk35bb]index.php/[/color:27sk35bb][color=#0080FF:27sk35bb]using-joomla/extensions/components/weblinks-component[/color:27sk35bb]
Alguns links funcionam se acrescentar o que destaquei em laranja. Desconfio que a opção para usar o rewrite do apache esteja desmacada. Desligue coisas como cache (e também limpe-o) e etc e tente novamente para ver se consegue acessar as páginas, com e sem SEF.
O importante é confirmar se o site funciona sem o SEF. Confira se os links do menu estão corretos.
