Consegui resolver...
Nas Preferências do Joomfish, o item Flags directory tem que estar com o caminho assim: /components/com_joomfish/images
O meu estava assim: /components/com_joomfish/images/flags
Por isso que as bandeiras não apareciam. Agora está tudo ok! <!-- s:P --><img src="{SMILIES_PATH}/icon_razz.gif" alt="

" title="Legal" /><!-- s:P -->