Se nesse template der pra inserir código html, com certeza.
Por exemplo, no index.php, aonde você quiser que apareça um módulo, você coloca o seguinte código:
<jdoc:include type="modules" name="posicao" />
Na área administrativa, onde aparecerão as mensagens do sistema, vai o seguinte código:
<jdoc:include type="message" />
E o conteúdo vai onde tiver este código:
<jdoc:include type="component" />
Lembrando que tudo funciona fora das tags php, ou seja, no html puro.
Boa sorte.
