Fala galera!!! <!-- s:ugeek: --><img src="{SMILIES_PATH}/icon_e_ugeek.gif" alt=":ugeek:" title="Uber Geek" /><!-- s:ugeek: -->
Eu também passei por esse problema. Me matei procurando uma solução, tentei todas inclusive essa do nosso amigo andreguimel mas continuava o ícone do joomla lá. O problema é que estava usando um template JA T3 Framework e nada parecia funcionar.
Porém a dica do andreguimel me deu a luz que precisava.
Vamos a solução:
- Usando o firefox, copiei o HTML interno da página.
- Depois foi só procurar pela pela palavra
favicon.ico e pronto ele estava neste link
<link href="/plugins/system/jat3/jat3/base-themes/default/images/favicon.ico" rel="shortcut icon" type="image/x-icon">
-Depois disso só substituí o arquivo favicon.ico padrão do joomla pelo meu favicon.ico personalisado.
#fik a dica ai psoal <!-- s;) --><img src="{SMILIES_PATH}/icon_e_wink.gif" alt="

" title="Piscada" /><!-- s;) -->
"Compartilhar conhecimento traz mais crescimento do que se imagina"
Sílvia Somenzi